Aufgrund der steigenden Einwohnerzahlen in Leinefelde wurde trotz des umfangreichen Umbaus die Alte Kirche zu klein. Nach Bemühungen des damaligen Pfarrers wurde ab 1886 die dreischiffige, neugotische Neue Kirche gebaut und ebenfalls als Patronat Hl. Maria Magdalena geweiht. Eingerichtet wurde die Kirche Anfang des 20. Jahrhunderts. Besonders waren der Einbau des Hochaltars und der Bau eines Freilandkreuzweges. Das Taufbecken wurde von der Alten Kirche übernommen. Die Kirche verfügt über einen 56 Meter hohen Turm mit Spitzdach.